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高通量測序(NGS)技術因通量高、速度快等優勢在基因檢測中的應用越來越廣泛,在基礎研究和臨床輔助診斷方面發揮了巨大作用,NGS實驗流程包括核酸提取、文庫構建、上機測序、數據分析等步驟,其中文庫構建是非常關鍵的一環,對整個實驗結果影響最大。
為滿足市場需求,百奧醫藥在積累大量二代測序相關實驗經驗基礎上,自主研發了二代測序mRNA和DNA建庫系列試劑盒,可廣泛應用于二代測序等相關科學研究實驗。
百奧醫藥mRNA建庫試劑盒
一、產品介紹
百奧醫藥mRNA建庫試劑盒(Cat.BA3105)是針對高通量測序平臺專門研發的用于mRNA轉錄組文庫構建試劑盒。本試劑盒適用于起始量在10ng-1ug之間完整度良好的動植物和真菌等真核生物的Total RNA 。Total RNA樣品經過mRNA分離、mRNA片段化、cDNA合成、末端修復和加A、接頭連接、連接產物純化和片段大小分選、文庫擴增等步驟,最終得到適用于Illumina平臺的測序文庫。本試劑盒利用磁珠分選的方式,可以快速獲得特定長度的文庫,能夠滿足不同實驗的個性化需求。
產品貨號 |
產品名稱 |
產品規格 |
儲藏條件 |
BA3305 |
百奧醫藥mRNA建庫試劑盒(Module II) |
24rxns |
-20℃避光保存 |
二、應用領域
基因表達分析;單核苷酸變異分析;剪切變異體分析;基因融合鑒定。
三、測試效果
文庫產出:從動物(293T細胞)、植物(擬南芥)、真菌(酵母)中提取Total RNA后,分別以1ug、100ng、10ng的起始量,使用百奧醫藥mRNA建庫試劑盒(Cat:BA3105)和目前廣泛應用的N*公司進口mRNA建庫試劑盒構建文庫。由結果看出,相同循環數下使用百奧醫藥mRNA建庫試劑盒的文庫產出好于對標品,尤其在低起始量下優勢更大。
數據產出質量:以1μg的293T細胞Total RNA起始,分別以百奧醫藥mRNA建庫試劑盒(Cat:BA3105),N*公司的mRNA試劑盒,以及國內V*公司的mRNA試劑盒構建文庫,質控后的文庫用Illumina NovaSeq 6000測序。從下機數據分析結果看,與同類試劑盒產品對標,百奧醫藥mRNA建庫試劑盒整體表現出色,尤其在比對率和基因檢出數上優勢更大。
表1 百奧醫藥、N*公司以及V*公司mRNA建庫試劑盒構建的文庫測序數據對比
基因表達一致性:整理百奧醫藥mRNA建庫試劑盒(Cat:BA3105),N*公司的mRNA試劑盒,以及V*公司的mRNA試劑盒構建的文庫基因表達數據,然后進行相關性分析,從結果看出,百奧醫藥mRNA建庫試劑盒構建的文庫產出的基因表達數據與市面上同類產品重復極好。
百奧醫藥DNA建庫試劑盒
一、產品介紹
百奧醫藥DNA建庫試劑盒(Cat.BA3106)是針對Illumina高通量測序平臺定向研發的建庫試劑盒。本產品適用100 pg - 1μg 起始DNA,包含常規動植物基因組、微生物基因組、FFPE、cfDNA、ChIP DNA 等樣本。試劑盒中的每種試劑都經過了嚴格的質量控制,且每一批次的建庫 Kit 都經過了建庫和上機測序的驗證,保證每一批次的試劑盒性能質量穩定。
產品貨號 |
產品名稱 |
產品規格 |
儲藏條件 |
BA3106 |
百奧醫藥DNA建庫試劑盒 |
24rxns |
-20℃避光保存 |
二、 應用領域
全基因組測序;全外顯子或靶向捕獲測序;擴增子測序;免疫共沉淀測序;宏基因組測序
三 、測試效果
文庫產出:以239 T細胞片段化DNA為樣本進行建庫,DNA起始量分別為100 pg、1 ng、100 ng和1 μg,分別以百奧醫藥DNA建庫試劑盒(Cat:BA3106)和N*公司DNA建庫試劑盒構建文庫。由結果可知,對于不同起始量DNA,百奧醫藥DNA建庫試劑盒在相同擴增循環數下文庫產出均高于對標品。
數據覆蓋度:分別以起始量1ug的DNA標準品NA12878和GW-OGTM800為樣本進行建庫,分別使用百奧醫藥DNA建庫試劑盒(Cat:BA3106)和N*公司DNA建庫試劑盒構建文庫。質控后的文庫用Illumina NovaSeq 6000測序,對測序數據量進行均一化,分析結果顯示,百奧醫藥DNA建庫試劑盒構建的文庫去重后的測序深度更高。